场景1 大鼠小鼠脑影像精确配准

小鼠脑影像个体间解剖差异显著，手动配准复杂易出错，软件内置艾伦小鼠脑图谱及多种大鼠组织概率图谱，一键式精准配准，无需手动调整参数。

不同分析流程涉及大量繁琐步骤与参数调整，手动操作耗时。软件支持从体素缩放、头动校正到指标计算的全流程一键式运行，大幅节省手动处理的时间。

啮齿类动物模型研究往往需要多维度证据，不同模态数据需要切换多款软件、手动整理指标、分析流程割裂且标准不一。软件同时支持功能像、结构像、弥散像等多种模态分析，一站式获取多维度脑影像指标，探查动物模型脑机制。

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1.1 基于大鼠静态指标分析软件

大鼠静态指标分析软件是对大鼠的功能像进行的预处理以及指标计算，可以一键式针对大鼠的的静息态功能磁共振序列的图谱，以及一系列的体素缩放、去除时间点、时间层校正、头动校正、空间标准化、空间平滑、去线性趋势、回归协变量、滤波以及ALFF、fALFF、ReHo等十余种指标的计算。

1.2 基于小鼠静态指标分析软件

针对小鼠静息态功能磁共振序列一键式完成预处理步骤，支持通过开关选择运行预处理模块，进行流程的灵活配置，便于根据具体需求进行预处理。并计算ALFF、fALFF、ReHo、DC等十余种局部指标，支持输出规范化静态指标结果。

1.3 基于小鼠功能连接梯度分析软件

针对小鼠脑影像，通过基于皮尔逊相关构建全脑功能连接矩阵，运用扩散图嵌入等降维技术提取主要梯度成分。支持去倾斜、去峰值、头动校正、图像平均等预处理步骤及功能连接梯度计算。

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2.1 大鼠基于体素的形态学测量分析软件

大鼠基于体素的形态学分析软件可在体素级别定量评估局部灰质体积的差异，一键式针对大鼠的结构像功能磁共振序列进行体素缩放、脑提取、配准、分割等处理，生成灰质体积指标。

2.2 小鼠基于体素的形态学测量分析软件

针对小鼠的结构像功能磁共振序列进行分割，体素缩放、平滑等处理，生成灰质体积指标。一键式将小鼠结构像数据分割成灰质，白质等组织。

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3.1 大鼠DTI基于白质骨架的统计分析软件

大鼠基于白质骨架的统计分析软件可基于白质骨架进行白质微观指标的体素级组间比较。一键式对大鼠进行白质骨架创建、基于白质骨架的统计分析、结果膨胀等。

3.2 小鼠DTI基于白质骨架的统计分析软件

一键式对小鼠进行Mask创建，白质骨架创建，基于白质骨架的统计分析，结果膨胀等，输出两种比较方向的组间统计结果文件和校正后结果文件、结果膨胀后文件等。